بخش مهمی که در طراحی فروشگاه اینترنتی باید در نظر بگیرید، مراحل پرداخت الکترونیکی و اتصال به درگاه است. این قسمت باید کاملا استاندارد و به دور از مشکل باشد؛ در غیر اینصورت شما با یک برچسب بزرگ بی‌اعتمادی از سمت مشتری مواجه خواهید شد که هیچوقت پاک نخواهد شد. پس  در بخش طراحی سایت فروشگاهی و طراحی مراحل پرداخت باید دقت کافی انجام شود.

از هر چه بگذریم ظاهر قضیه را نمی‌توان نادیده گرفت. همیشه ظاهر آن چیزی است که مشتری بیش از هر چیزی به آن توجه می‌کند. در طراحی فروشگاه اینترنتی باید فاکتورهای زیبایی و جذابیت را در نظر بگیریم؛ همچنین در انتخاب تصاویر محصول از همان ابتدای کار باید دقت لازم را داشته باشید. وقتی مشتری بصورت کاملا مجازی محصول را می‌بیند باید بتواند تشخیص دهد این محصول چگونه است وگرنه از خرید محصول صرف نظر کرده و ترجیح می‌دهد آن را بعدها بصورت فیزیکی ببیند و تهیه کند.

یکی از مسائلی که بیشترین اهمیت را دارد، بحث امنیت است. در واقع اگر در طراحی فروشگاه اینترنتی امنیت را رعایت نکنید مسلما با شکست مواجه خواهید شد. اما چگونه می‌توان این امنیت را زمان طراحی سایت فروشگاهی رعایت کرد؟
مسلما با کدنویسی استاندارد و صحیح. اگر در کدنویسی خود بی‌دقتی کنید ممکن است با یک شکاف امنیتی بزرگ در آینده رو به رو شوید. یا اگر افزونه‌هایی را نصب کنید که از استاندارد خوبی برخوردار نباشند، به راحتی می‌توانید مورد حمله قرار گیرید. پس لطفا در طراحی سایت نهایت دقت را به کار ببرید و پس از آن نیز با ابزارهای آنلاین و افزونه‌های معتبر، امنیت فروشگاه اینترنتی را تامین کنید.

یادتان باشد، حرف اول را مشتری می‌زند. هر کاری می‌کنید باید در جهت جلب رضایت مشتری باشد. در طراحی فروشگاه اینترنتی باید به گونه‌ای قدم بردارید که مشتریان زیادی جذب کنید و آن‌ها را به خود وفادار سازید. یکی از مراحلی که باید در طراحی سایت فروشگاه اینترنتی باید به آن دقت شود، کاربرپسند بودن است. هر طور حساب کنید یک فروشگاه اینترنتی پیچیدگی‌های خاص خود را دارد، ولی باید به سمتی قدم بردارید که این محدودیت‌ها را از بین ببرید. برای این منظور تا می‌توانید باید سطوح دسترسی را ساده‌تر کنید تا مشتری به راحتی هر آنچه می‌خواهد را مشاهده کرده و طی چند قدم ساده محصول را خریداری کند. مسلما این وظیفه طراح است و باید به این موضوع توجه ویژه‌ای کند.